中新社哈爾濱10月8日電(史軼夫) 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院黑龍江水產(chǎn)研究所8日對(duì)外發(fā)布,,由該院孫效文研究員領(lǐng)銜的國(guó)際合作研究團(tuán)隊(duì),,完成了鯉魚(yú)全基因組序列圖譜繪制,,并揭示其獨(dú)特的全基因組復(fù)制事件,,這是國(guó)際上首個(gè)完成全面解析的異源四倍體硬骨魚(yú)類(lèi)基因組圖譜。該研究成果近日發(fā)表于《自然-遺傳》(NatureGenetics)雜志,。
鯉魚(yú)是全球分布和養(yǎng)殖范圍最廣泛的經(jīng)濟(jì)魚(yú)類(lèi)之一,,是中國(guó)具有代表性的淡水養(yǎng)殖魚(yú)類(lèi),是最有條件利用基因組資源進(jìn)行品種改良的水產(chǎn)養(yǎng)殖物種,。鯉魚(yú)基因組由100條染色體組成,,是迄今完成全基因組測(cè)序的脊椎動(dòng)物中染色體數(shù)目最多的物種。
該研究團(tuán)隊(duì)完成了雌核發(fā)育鯉魚(yú)的基因組深度測(cè)序,、精細(xì)圖譜繪制和基因組注釋?zhuān)浠蚪M由16.9億堿基組成,,含有52610個(gè)功能基因,約為多數(shù)硬骨魚(yú)類(lèi)基因數(shù)目的兩倍,。研究團(tuán)隊(duì)從基因組尺度證實(shí)了鯉魚(yú)基因組的異源四倍體特征及其獨(dú)特的全基因組復(fù)制事件,,分子鐘證據(jù)表明鯉魚(yú)基因組四倍化大約發(fā)生在820萬(wàn)年前,是迄今在脊椎動(dòng)物中發(fā)現(xiàn)的最近的全基因組倍增事件,。研究團(tuán)隊(duì)還開(kāi)展了全球10個(gè)代表性品系(種群)33尾鯉魚(yú)的基因組重測(cè)序研究,,首次繪制了全球鯉魚(yú)的單堿基分辨率基因組遺傳變異圖譜,。此外,通過(guò)全基因組多態(tài)性?huà)呙韬捅容^轉(zhuǎn)錄組分析等手段,,識(shí)別和定位了鯉魚(yú)鱗被缺失,、體色決定等性狀相關(guān)的遺傳位點(diǎn)、功能基因和調(diào)控通路,。
鯉魚(yú)全基因組序列圖譜的完成,,標(biāo)志著鯉科魚(yú)類(lèi)重要經(jīng)濟(jì)性狀的遺傳解析和遺傳選育研究全面進(jìn)入基因組時(shí)代。對(duì)于解析鯉科魚(yú)類(lèi)生長(zhǎng),、品質(zhì),、抗病、抗逆等重要經(jīng)濟(jì)性狀的分子機(jī)制具有重要意義,,同時(shí)也為研究脊椎動(dòng)物基因組進(jìn)化和基因衍化機(jī)制提供了寶貴的數(shù)據(jù)和模型,為開(kāi)展全基因組選擇育種,,培育品質(zhì)優(yōu)良的鯉魚(yú)新品種奠定了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ),,具有重要的理論意義和應(yīng)用價(jià)值。